快速入门指南

安装依赖

1. 确保已安装 PyMOL、Claude Desktop、Python 3.10+ 和 Git。
2. 安装 UV 包管理器：
   • macOS: brew install uv
   • Windows: 执行以下命令

     powershell -c "irm https://astral.sh/uv/install.ps1 | iex"
     set Path=C:\Users\[YourUsername]\.local\bin;%Path%
     

克隆项目

git clone https://github.com/vrtejus/pymol-mcp
cd pymol-mcp

设置虚拟环境

1. 创建并激活虚拟环境：
   • macOS/Linux:

     python -m venv venv
     source venv/bin/activate
     

   • Windows:

     python -m venv venv
     venv\Scripts\activate
     

2. 安装依赖：pip install mcp

配置 Claude Desktop

编辑配置文件 claude_desktop_config.json，添加如下内容：

{
  "mcpServers": {
    "pymol": {
      "command": "[Python路径]",
      "args": ["[脚本路径]"]
    }
  }
}

安装 PyMOL 插件

1. 打开 PyMOL，进入 Plugin → Plugin Manager。
2. 点击 "Install New Plugin"，选择 pymol-mcp-socket-plugin/__init__.py 文件。

使用方法

1. 在 PyMOL 中启动插件监听（Plugin → PyMOL MCP Socket Plugin → Start Listening）。
2. 在 Claude Desktop 中点击工具图标，开始使用。

更多命令示例及问题排查请参考 README。