Biomart-MCP:生物数据接口服务器

Biomart-MCP:生物数据接口服务器

一个用于与 Biomart 数据库交互的 MCP 服务器,支持数据检索和 ID 转换。

快速入门

安装

  1. 克隆仓库: git clone https://github.com/jzinno/biomart-mcp.git cd biomart-mcp
  2. 使用虚拟环境(可选): uv venv source .venv/bin/activate (MacOS/Linux) .venv\Scripts\activate (Windows)
  3. 安装依赖: uv sync
  4. 启动开发模式服务器: mcp dev biomart-mcp.py

配置客户端

  • Claude Desktop:运行以下命令安装服务器: uv run --with mcp[cli] mcp install --with pybiomart biomart-mcp.py
  • Cursor:在设置中添加 .cursor/mcp.json 文件,配置示例见 README。
  • Glama:点击徽章快速配置。

功能特性

  • 支持数据库发现、属性和过滤器探索。
  • 提供数据检索和生物 ID 转换功能。