PubChem MCP 服务器

PubChem MCP 服务器

使大语言模型能够正确查询分子数据库并生成结构文件。

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快速入门

  1. 克隆仓库： git clone https://github.com/PhelanShao/pubchem-mcp-server.git cd pubchem-mcp-server/python_version

  2. 安装依赖： pip install -e . （如果需要增强的3D结构支持，运行：pip install -e ".[rdkit]"）

  3. 配置MCP服务器： 在MCP配置文件中添加以下内容（替换路径为实际路径）： { "mcpServers": { "pubchem": { "command": "python3", "args": ["/path/to/pubchem-mcp-server/python_version/mcp_server.py"], "env": { "PYTHONUNBUFFERED": "1" } } } }

  4. 使用工具：

    • 获取化合物数据：get_pubchem_data
    • 下载结构文件：download_structure

详细用法参考README文档。